活性污泥中的各種微生物都有它們適應的PH值范圍，一般適宜的PH值在6-9之間。PH在4.5以下，活性污泥中原生動物將全部消失，大多數微生物的活動受到抑制。只有真菌成為優勢菌種。活性污泥絮體受到損壞，極易產生污泥膨脹。當PH值大于9后，微生物的代謝速率將受到極大的不利影響，菌膠團會解體，污泥懸浮物增大，出水惡化。